El tomate de árbol es muy popular en Sudamérica, siendo una alternativa en la producción, diversificación y comercialización de productos no tradicionales; además, es un cultivo prometedor para ciertas regiones de clima mediterráneo. Su producción se ve limitada por factores como: falta de diferenciación entre variedades, uso de materiales no adecuados, o sustitución de variedades locales por las de otros orígenes. Es una especie marginada, no considerada en programas de conservación y mejora de recursos fitogenéticos; el estudio de su diversidad mediante la caracterización de sus recursos es esencial para su aprovechamiento y conservación. Este trabajo constituye una primera caracterización del tomate de árbol, con un importante número de descriptores morfológicos y marcadores AFLPs, basada en una amplia variedad de accesiones provenientes de diferentes regiones; contribuyendo así al conocimiento de su diversidad e implicaciones en su conservación y mejora genética. Esta obra es de interés para aquellos estudiantes, técnicos, académicos, e investigadores que deseen conocer o emprender estudios en este cultivo; sirviendo como ejemplo para el estudio de diversidad en otras especies.